Partiendo del principio de reconocimiento del ciudadano del Sur como agente de su propio desarrollo, todos los programas de Fundeso, buscan, como EJE TRANSVERSAL el fortalecimiento de la sociedad civil como el mejor garante de estructuras de democracia participativa y de justicia social.
La visión de Fundeso se fundamenta en reconocer y promover la dignidad, el autodesarrollo y la autosuficiencia de las poblaciones con las que trabaja.
La misión de Fundeso es luchar contra la pobreza y la injusticia en el mundo promoviendo el progreso humano, económico y social por medio de programas, que faciliten el desarrollo sostenible de los países en vías de desarrollo, fomentando el papel protagonista de los ciudadanos del Sur.
Asimismo, Fundeso fomenta en España programas de sensibilización y cauces de participación para que los ciudadanos asuman activamente su responsabilidad frente las desigualdades que existen en el mundo.